سوارز در سال 2011 جانشین خوان دی کستیلوی مکزیکی شد و بلافاصله هدایت این تیم را در دو تورنمنت کونکاکاف 2011 و المپیک 2012 لندن بر عهده گرفت. این سرمربی اکوادری، تیم ملی هندوراس را تا جمع 4 تیم پایانی مسابقات جام ملت ها بالا آورد و همچنین موفق شد آبی ها را به صعود از گروه خود در المپیک سوق دهد.

پس از بدون امتیاز پایان بردن جام جهانی، سوارز تصمیم گرفته است قراردادش را با فدراسیون فوتبال هندوراس تمدید نکند. وی در یک کنفرانس خبری به خبرنگاران گفت:

"پنج دقیقه پیش، من تصمیم گرفتم که این پست را ترک کنم. این یک استعفا نیست بلکه اتمام یک قرارداد است. فکر می کنم این تغییر، برای هر دو طرف لازم باشد. در هندوراس کار خوبی انجام دادیم و من از این مسئله راضی هستم. قاعدتا منظورم جام جهانی نیست بلکه پروسه ای است که برای تغییر نسل بازیکنان، صورت پذیرفت."

"در این راه با مشکلات فراوانی روبرو شدیم زیرا می خواستیم نسلی را عوض کنیم که از شخصیت و قدرت بالایی برخوردار بود. در هر صورت توانستیم تاثیر مثبتی بر تیم بگذاریم و حتی در المپیک، از گروهمان بالا بیاییم. فکر می کنم این مسئله، در آینده هندوراس، بیشتر نمود خواهد داشت. به نظرم فرد دیگری می تواند به اینجا بیاید و باعث فوتبال این کشور شود. من هیچوقت مهربانی مردم این کشور را فراموش نخواهم کرد. همه چیز در برزیل سخت شد، فکر می کردم که می توانیم از گروه خود صعود کنیم. من همیشه هوادار هندوراس خواهم بود."