او پس از مدتها مبارزه با این بیماری مهلک در تاریخ بیست و سوم آبان ۱۳۹۳ دارفانی را وداع گفت. بسیاری از یادگاری های مرتضی پاشایی در اتاقش همچنان به زندگی ادامه می دهند. این عکس اتاق مرتضی در منزل پدر و مادرش گرفته شده است. به نوشته برادر مرتضی “این وسایل مرتضی است که تا وقتی هستیم دست نخواهد خورد.