سیامک نعمتی که در تعطیلات نیم فصل دوره قبل در فهرست مازاد پرسپولیس قرار گرفته بود، در آغاز فصل جدید از این تیم جدا شد. نعمتی با ۱۷۴ بازی برای پرسپولیس، از جمله بازیکنان با تجربه این تیم محسوب می‌شد. او ۱۷ گل برای پرسپولیس زد، ۱۲ پاس گل داد و ۵ پنالتی گرفت.

حضور نعمتی در پرسپولیس مصادف با عصر طلایی این تیم بود تا این بازیکن در زمره بازیکنان پرافتخار پرسپولیس قرار گیرد. نعمتی در۵ قهرمانی از ۶ قهرمانی پیاپی پرسپولیس همراه این تیم بود تا پس از کمال کامیابی‌نیا پرافتخارترین بازیکن پرسپولیس در لیگ برتر باشد.

نعمتی در پرسپولیس ۵ بار قهرمان سوپرجام شد، ۲ بار قهرمان جام حذفی رابه دست آورد و ۲ بار هم به فینال لیگ قهرمانان آسیا راه یافت تا روزهای فراموش نشدنی را در این تیم تجربه کند. نعمتی در پرسپولیس در مجموع با ۳ مربی کار کرد که بیشتر از همه تحت نظر یحیی گل‌محمدی به میدان رفت. جلال حسینی هم ۱۲۴ بازی در کنار نعمتی بازی کرد و نعمتی بیش از هر بازیکن دیگری با سید جلال همبازی بوده است.