در شرایطی که مدیریت باشگاه استقلال تلاش زیادی کرد تا مشکلات این باشگاه را به حداقل برساند، اما همچنان موانع زیادی باعث ایجاد مشکلات دیگر شده است. در این بین یکی از مهمترین مشکلات مسدود بودن حساب باشگاه استقلال است که دلیلی جز بدهی به اداره مالیات و بیمه ندارد.

بدهی باشگاه استقلال به اداره مالیات 230 میلیارد تومان بود که با اقدام مسئولان باشگاه به 170 میلیارد تومان رسیده است. همچنین بدهی استقلالی‌ها به بیمه نیز 40 میلیارد تومان بوده است که جمع بدهی‌های آبی‌پوشان به اداره مالیات و بیمه به رقمی بالغ بر 200 میلیارد می‌رسد. مسئولان استقلال در حال رایزنی هستند تا بتوانند با رایزنی با اداره مالیات و بیمه حساب باشگاه را باز کنند.

بدهی مالیاتی از طریق کمیسیون ماده 251 مکرر و بدهی بیمه از طریق مراجعه به دیوان عدالت اداری در حال پیگیری است. این بدهی‌ها برای سال‌های گذشته بوده که گریبانگیر مدیریت فعلی شده است.