علت تشكيل شدن شوراي عالي اصلاحات اين بود كه 11نفر از اعضاي شوراي هماهنگي اصلاحات با روندي كه تحتعنوان كميته انتخابات در شوراي هماهنگي جبهه اصلاحات شكل گرفته بود، مخالف بودند و اين بدعتي بود كه براي نخستينبار در شوراي هماهنگي اصلاحات گذاشته شده بود. هميشه مسائل انتخابات در كميته سياسي شوراي هماهنگي جبهه اصلاحات در سالهاي سال بررسي ميشد. اين اتفاق باعث عدمرضايت اكثريت شد، شوراي راهبردي از طرف ديگر كار خود را به صورت كامل انجام داده بود و در 23 استان تشكيلات خود را برقرار كرده بود اما پيشنهادي داده شد تا براي اينكه جلوي فعاليت غيرحقوقي تحت عنوان كميته انتخابات گرفته شود جمع جديدي متشكل از شوراي هماهنگي و شوراي راهبردي و آقاي عارف و برخي افراد مانند آقاي منتجبنيا و مجمع اصلاحطلبان تشكيل شود. اتفاقا پيشنهاد اين مورد هم توسط آقاي غريباني به رئيس دولت اصلاحات داده شد و ايشان موافقت كردند كه احزاب تازهتاسيس مانند ندا و اتحاد و احزاب درشرف تاسيس هم حضور داشته باشند و آقاي عارف هم اگر صلاح ديدند هر شخصيت حقيقي ديگر را به جمع شوراي عالي اضافه كنند كه پنج نفر توسط آقاي عارف به جمع اضافه شدند. البته واقعيت اين است كه برخي از دوستان منتقد ميخواستند تركيب هيات رئيسه شوراي عالي سياستگذاري به شكل ديگر باشد كه اكثريت اين را نپذيرفتند. همچنین دو يا سه كارگروه در شوراي عالي بعدا انتخاب خواهند شد كه جزو هياترئيسه شوراي عالي خواهند شد و ممكن است آقاي محسن رهامي از جمله اين افراد باشد. در ضمن برخي فعالان سياسي اصلاحطلب از برخي اقدامات ناراحت بودند كه كميته انتخابات ممكن است، مشكلساز شود و شوراي عالي سياستگذاري براي حل و فصل اين موارد شكل گرفت؛ وگرنه شوراي راهبردي به فعاليت خود ادامه ميداد. در واقع به عبارتي اعضاي شوراي راهبردي ايثار کرده و كنارهگيري كردند و شوراي هماهنگي و كميته انتخابات هم كنارهگيري كردند و شوراي جديد و تازهای شكل گرفت كه بتواند نواقص گذشته را برطرف كرده و باهماهنگي عمل كند. در این بین بايد توجه داشت كه شوراي راهبردي تنها براي سياستگذاري است و قرار نیست كه در كار احزاب و حوزههاي انتخاباتي دخالت كند، چرا كه اين شورا تنها در راستای سياستگذاري وارد ميدان خواهد شد. احزاب بزرگ نیز اصلاحات پذيرفتهاند كه در اين انتخابات كاملا منسجم و هماهنگ عمل كنند. همچنین هيچ نهادي براي حوزههاي انتخاباتي در تهران تصميم نميگيرد و حوزههاي انتخاباتي مستقل عمل ميكنند اما اگر قرار بر اين شد كه دو اصلاحطلب در حوزهاي رقابت كنند بين اين دو نفر شوراي عالي حكميت انجام خواهد داد تا از اين طريق از شكسته شدن آراي اصلاحطلبان جلوگيري كند.