انفجار بندر شهید رجایی با دود نارنجی و تیره همراه بود که سرنخ‌هایی از مواد شیمیایی احتمالی ارائه می‌دهد، اما تکذیب حضور نیترات آمونیوم و نیاز به بررسی‌های آزمایشگاهی، ابهامات را افزایش داده است.